Se ubican en el Golfo de Nicoya y frente a playa Naranjo, por lo que las podés observar si viajás a Paquera desde el ferry de Puntarenas.
Esta isla es fiel protectora de especies de aves migratorias que vuelan a las islas en invierno para anidar. Algunas de las especies más conocidas son: el pelícano pardo (este cuenta con una de las poblaciones más grandes de esta especie de aves en Costa Rica), gaviotas, el halcón peregrino, la paloma coliblanca y los piqueros. Aproximadamente 200 aves residen en Guayabo.
La Reserva Biológica Isla Guayabo se extiende por un total de 15 ha, se encuentra a 8 km de Puntarenas y posee 50 m de altura. La isla fue alguna vez una zona montañosa pero con el paso de los años se desvaneció lentamente en el agua dejando solo la parte superior del terreno montañoso por encima de la superficie.
La isla está compuesta principalmente de rocas sedimentarias y se encuentra cubierta en algunos sectores por arbustos y plantas pequeñas espinosas; sobresalen especies de árboles como: el guaco, el higuerón, las palmas de coyol y la palma viscoyol.
La Reserva Biológica Isla Guayabo se caracteriza por poseer asombrosos acantilados por todo su perímetro y una playa de aguas cristalinas y arena blanca.