Manuel Antonio con un tamaño relativamente pequeño puedes apreciar tres tipos de ecosistemas, cada uno ofreciendo una biodiversidad distinta, es decir, es un Parque Nacional que recorres en un día, y en ese día vas a sentir como si descubrieses tres Parques Nacionales distintos.
Para empezar, el parque te recibe con una red de senderos variada para recorrer la selva tropical. Existen 10 senderos diferentes, algunos incluso están conectados entre sí.
La primera ruta de senderos incluye los siguientes: Manglar, Perezoso, Principal y Catarata. Estos son una increíble opción para personas con movilidad reducida por su facilidad y caminos accesibles. En esta ruta podrás encontrar los manglares, bosque con osos perezosos y también llegar a las playas.
La siguiente ruta de senderos incluye las rutas al Mirador, Playa Gemelas, Puerto Escondido y Los Congos. Este circuito está perfectamente conectado y ofrece un grado de dificultad más elevado, que ofrece acceso a miradores y Playa Gemelas. El último sendero que te falta explorar es Punta Catedral y La Trampa.
El segundo ecosistema que se puede explorar es el acuático, gracias a sus playas caracterizadas por arenas blancas y aguas cristalinas. La más famosa y transitada es la playa Manuel Antonio, conocida por su hermosa estética. Es ideal para los amantes de snorkel que deseen investigar los arrecifes de coral, donde encontrarás una gran variedad de fauna marina.
Playa Escapadilla Sur contrasta perfectamente con playa Manuel Antonio ofreciendo un tiempo más tranquilo, aprovechando su oleaje más pausado y menor cantidad de gente. Una formación rocosa divide Playa Gemelas, creando dos playas distintas paralelas. Esta formación de rocas ha sido cementada a lo largo de los años por la actividad tectónica de la zona y las corrientes marinas, generando un espectáculo para los visitantes, y ofreciendo más privacidad en un Parque Nacional muy transitado.
Los manglares nos adentran en el tercer y último ecosistema que se puede observar en Manuel Antonio, y representan la gran biodiversidad que presente esta área Protegida. Se pueden observar hasta 6 tipos diferentes de manglares, cada uno con flora y fauna diferente, pero siendo igual de importante para la conservación de dicha flora y fauna. En este ecosistema podrás observar osos hormigueros, cocodrilos, garzas y serpientes.